L'emplacement des données de MySQL est indiqué dans la variable datadir qui se trouve dans le fichier my.cnf. Toutefois, il peut exister plusieurs fichiers my.cnf :

$ mysqld --verbose --help | head -n13 | tail -n2
Default options are read from the following files in the given order:
/etc/my.cnf /etc/mysql/my.cnf ~/.my.cnf 

Éventuellement ce fichier contient des directives !includedir. Il faut alors chercher dans ces répertoires le fichier qui contient datadir.

Dans la suite, nous allons déplacer les données dans /home/mysql.

Tout d'abord on arrête le service :

$ sudo service mysql stop

On édite le fichier qui contient datadir :

datadir		= /home/mysql

On suppose que l'ancienne valeur de datadir était /var/lib/mysql. On déplace les données :

$ sudo mv /var/lib/mysql /home

Malheureusement cela ne suffit pas. Le premier problème vient du fichier/usr/share/mysql/mysql-systemd-start :

$ head  /usr/share/mysql/mysql-systemd-start -n25 | tail -n16
sanity () {
  if [ ! -r /etc/mysql/my.cnf ]; then
    echo "MySQL configuration not found at /etc/mysql/my.cnf. Please create one."
    exit 1
  fi

  if [ ! -d /var/lib/mysql ] && [ ! -L /var/lib/mysql ]; then
    echo "MySQL data dir not found at /var/lib/mysql. Please create one."
    exit 1
  fi

  if [ ! -d /var/lib/mysql/mysql ] && [ ! -L /var/lib/mysql/mysql ]; then
    echo "MySQL system database not found. Please run mysql_install_db tool."
    exit 1
  fi
}

Il faut donc créer le répertoire /var/lib/mysql/mysql avec les bons droits :

$ sudo mkdir -p /var/lib/mysql/mysql
$ sudo chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql
$ sudo chmod -R 700 /var/lib/mysql

Il faut maintenant configurer AppArmor. D'après ce qui suit, nous devons modifier le fichier local/usr.sbin.mysqld :

$ tail /etc/apparmor.d/usr.sbin.mysqld -n3
  # Site-specific additions and overrides. See local/README for details.
  #include <local/usr.sbin.mysqld>

Modifier le fichier /etc/apparmor.d/local/usr.sbin.mysqld en ajoutant :

# Allow data dir access
  /home/mysql/ r,
  /home/mysql/** rwk,

Rechargez :

sudo service apparmor reload

Redémarrez le service :

sudo service mysql start

Vérifiez le changement :

$ mysql -u root -p -e 'select @@datadir'
Enter password: 
+--------------+
| @@datadir    |
+--------------+
| /home/mysql/ |
+--------------+