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fah [Le 15/05/2007, 14:14]
83.200.122.235
fah [Le 31/08/2022, 23:33] (Version actuelle)
moths-art Passage de http à https sur les liens externes (détecté et corrigé via le bot wiki-corrector (https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=2067892)
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-{{tag>breezy dapper edgy divers recherche}}+{{tag>calcul_collaboratif}}
  
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 =====  Introduction ===== =====  Introduction =====
  
-Folding@Home est un projet de distribution de données à plusieurs ordinateurs qui étudie ​ le repliement des protéines, les repliements anormaux, l’agrégation des protéines, et les maladies liées. L'​idée est d'​utiliser des méthodes informatiques nouvelles et une répartition des données aux ordinateurs dit "​distribués"​ à grande échelle pour simuler des échelles de temps des milliers voire des millions de fois plus longues que celles qu’on réalisait auparavant. Cela nous a permis de simuler un repliement pour la première fois, et de mener désormais notre recherche vers l’étude des maladies associées.+[[http://​folding.stanford.edu/​French/​Main|Folding@Home]] est un projet de distribution de données à plusieurs ordinateurs qui étudie ​ le repliement des protéines, les repliements anormaux, l’agrégation des protéines, et les maladies liées. L'​idée est d'​utiliser des méthodes informatiques nouvelles et une répartition des données aux ordinateurs dit "​distribués"​ à grande échelle pour simuler des échelles de temps des milliers voire des millions de fois plus longues que celles qu’on réalisait auparavant. Cela nous a permis de simuler un repliement pour la première fois, et de mener désormais notre recherche vers l’étude des maladies associées.
  
  
  
  
-=====  Installation et parametrage ===== 
  
 +=====  Installation et paramétrage =====
  
-==== Installation ====+Il existe plusieurs méthodes pour installer F@H sur Ubuntu :
  
-  * Par exemple ​dans /​home/​[utilisateur]/​fah  +==== Installation via Origami (paquet inclus ​dans les dépôts)====
-  +
-  mkdir ~/fah+
  
-  ​Télécharger le client F@H dans le dossier nouvellement créé ​+(pour pc local et réseaux) 
 +     [[:​origami|Installation et lancement automatique avec l'​installateur Origami]] inclus ​dans les dépots d'​Ubuntu.
  
-  cd ~/fah +==== Installation via finstall ====
-  wget http://​www.stanford.edu/​group/​pandegroup/​release/​FAH504-Linux.exe+
  
 +(pour pc local seulement)
 +     * [[:​fah_finstall|Installation et lancement automatique avec l'​installateur finstall]]. ​
  
-  * Changer les droits du fichier+==== Installation manuelle ====
  
-  chmod +x FAH504-Linux.exe+(pour pc local seulement)
  
-  ​Exécuter le programme afin de paramétrer F@H ([[http://​folding.extremeoverclocking.com/​team_list.php|Liste des équipes]], Alliance Francophone:​ 51 ou Linux: 163 ou ...)+pour 32bits et 64 bits: 
 +     * [[:fah_installation_manuelle|Installation manuelle et lancement automatique]] 
  
-  ./​FAH504-Linux.exe -configonly 
  
-  ​Entrer les infos requises ​+===== Suivi du travail en cours ===== 
 +Il existe plusieurs applications graphiques de suivi: 
 +  ​[[http://​prothink.sourceforge.net/​|Protein Think]] 
 +  * [[http://​fahmon.net/​|FahMon]] (pour l'​installation voici [[http://​ubuntuforums.org/​showthread.php?​t=703180|un sujet du forum anglais]] qui s'​inspire de [[http://​trac.fahmon.net/​wiki/​CompilingForLinux|cette page officielle]])
  
 +===== Limitation de l'​utilisation CPU====
  
 +  * [[:​cpulimit]] : permet de limiter l'​utilisation du ou des processeur(s) par un processus déjà lancé ou qui le sera.
 +  * (en) [[https://​ubuntuforums.org/​showthread.php?​t=992706|Discussion à propos de l'​utilisation de l'​utilitaire cpulimit avec F@H]]
  
-==== Création du fichier de demarrage automatique  ​====+===== TeamUbuntu (45104) =====
  
-  * Créer un fichier nommé fah dans le dossier ​/etc/init.d+Si vous aimez Ubuntu, vous pouvez choisir de rejoindre la [[https://wiki.ubuntu.com/​FoldingAtHomeTeamUbuntu|TeamUbuntu]] en choisissant l'​équipe n°45104 lors de votre installation.
  
-  sudo gedit /​etc/​init.d/​fah+===== Liens utiles =====
  
-  * Maintenant, copier les infos suivantes à l'​intérieur +  * [[https://help.ubuntu.com/community/FoldingAtHome|F@H sur Documentation Ubuntu ​(en anglais)]] 
- +  ​[[https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=6803|Topic de discussion F@H sur le forum Ubuntu-fr]] 
-  #!/bin/sh +  * [[http://forum.folding-community.org/viewtopic.php?t=11700|Folding forum (anglais)]] 
-  # /etc/init.d/fah for Ubuntu +  * [[http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&​teamnum=45104|Statistiques de la TeamUbuntu]]
-  # Start/stop/restart the F@H service. +
-   +
-  export FAH_HOME=~/​fah +
-   +
-  fah_start() { +
-  ​if -x "​$FAH_HOME/​startfah.sh"​ ]; then +
-  echo "​Starting F@H$FAH_HOME/startfah.sh"​ +
-  "​$FAH_HOME/startfah.sh" +
-  fi +
-  } +
-   +
-  fah_stop() { +
-  sudo killall FAH504-Linux.exe +
-  } +
-   +
-  fah_restart() { +
-  fah_stop +
-  sleep 2 +
-  fah_start +
-  } +
-   +
-  case "​$1"​ in +
-  '​start'​) +
-  fah_start +
-  ;; +
-  '​stop'​) +
-  fah_stop +
-  ;; +
-  '​restart'​) +
-  fah_restart +
-  ;; +
-  *) +
-  fah_start +
-  esac +
- +
- +
-Sauvegarder et fermer gedit. +
- +
-  * Changer les droits du fichier +
- +
-  sudo chmod +x /etc/init.d/fah +
- +
-==== Démarrage automatique au lancement d'Ubuntu ​====  +
- +
-  * Maintenant, nous allons créer le script startfah.sh +
-  +
-  gedit ~/​fah/​startfah.sh +
- +
-  * Copier les informations suivantes à l'​intérieur  +
- +
-  #!/bin/sh +
-   +
-  export FAH_HOME=~/​fah +
-   +
-  cd $FAH_HOME +
-  $FAH_HOME/​FAH504-Linux.exe >/​dev/​null 2>&1 & +
-  exit 0 +
-  +
-Vous pouvez ajouter les paramètres -forceasm et -advmethods ou d'​autres ... +
- +
-Plus d'​infos sur (en anglais) : [[http://www.liquidninjas.com/bbs/showthread.php?t=3270]] +
- +
-  * Changer les droits du fichier  +
- +
-  chmod +x ~/fah/startfah.sh +
- +
- +
- +
-  * Etape finale, créer un lien dans ///etc/rc2.d/+
- +
-  sudo ln -/etc/init.d/fah /​etc/​rc2.d/​S99fah +
- +
-Pour tester le script, rebooter ou entrer la commande : +
- +
-  sudo /​etc/​init.d/​fah start +
- +
-Lancer le moniteur système, l'​utilisation CPU doit être a 100% !!! +
- +
-==== Remarques ==== +
- +
-  * 1- Si le programme ne se lance pas à la session suivante, revérifier chacune des étapes. Si tout est correct, essayer la manipulation suivante: +
- +
-  sudo apt-get install bum +
- +
-Ensuite, aller dans Système->​Administration->​BootUp Manager +
-Vérifier que le script fah soit bien présent dans la liste et coché. On peut également démarrer/​arrêter le service depuis ce programme si besoin. +
- +
-Une fois coché, valider les changements et relancer la session. Le programme Folding@Home devrait se lancer. +
- +
-  * 2- Si le programme ne se lance toujours pas, modifier le script "​startfah.sh"​. +
- +
-Supprimer "​export FAH_HOME=~/​fah"​ +
- +
-Remplacer tout les "​$FAH_HOME"​ par l'​emplacement exacte du dossier F@H, c'est à dire : "/​home/​[utilisateur]/fah" (évidement,​ [utilisateurest a remplacer par la bonne valeur) +
- +
-Relancer le script+
  
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-//Contributeur ​: Traduit/​Rédigé par [[utilisateurs:​dukiclock]]+//Contributeurs ​: Traduit/​Rédigé par [[utilisateurs:​dukiclock]] et [[utilisateurs:​YannUbuntu]]
 Remarques et commentaires ​ sur le [[http://​forum.ubuntu-fr.org/​viewtopic.php?​pid=44821#​p44821|forum Ubuntu-fr]].//​ Remarques et commentaires ​ sur le [[http://​forum.ubuntu-fr.org/​viewtopic.php?​pid=44821#​p44821|forum Ubuntu-fr]].//​
  • fah.1179231269.txt.gz
  • Dernière modification: Le 18/04/2011, 14:41
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