Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- fah [Le 10/03/2008, 04:13]
YannUbuntu ajout Protein Think
+++ fah [Le 31/08/2022, 23:33] (Version actuelle)
moths-art Passage de http à https sur les liens externes (détecté et corrigé via le bot wiki-corrector (https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=2067892)
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-{{tag>dapper edgy feisty gutsy divers}}
+{{tag>calcul_collaboratif}}
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 =====  Introduction =====
-Folding@Home est un projet de distribution de données à plusieurs ordinateurs qui étudie  le repliement des protéines, les repliements anormaux, l’agrégation des protéines, et les maladies liées. L'idée est d'utiliser des méthodes informatiques nouvelles et une répartition des données aux ordinateurs dit "distribués" à grande échelle pour simuler des échelles de temps des milliers voire des millions de fois plus longues que celles qu’on réalisait auparavant. Cela nous a permis de simuler un repliement pour la première fois, et de mener désormais notre recherche vers l’étude des maladies associées.
+[[http://folding.stanford.edu/French/Main|Folding@Home]] est un projet de distribution de données à plusieurs ordinateurs qui étudie  le repliement des protéines, les repliements anormaux, l’agrégation des protéines, et les maladies liées. L'idée est d'utiliser des méthodes informatiques nouvelles et une répartition des données aux ordinateurs dit "distribués" à grande échelle pour simuler des échelles de temps des milliers voire des millions de fois plus longues que celles qu’on réalisait auparavant. Cela nous a permis de simuler un repliement pour la première fois, et de mener désormais notre recherche vers l’étude des maladies associées.
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 =====  Installation et paramétrage =====
-Il existe plusieurs méthodes pour installer F@H sur Ubuntu. Ci-dessous nous présenterons l'installation manuelle.
+Il existe plusieurs méthodes pour installer F@H sur Ubuntu :
-Voir aussi les autres méthodes sur la page de [[https://help.ubuntu.com/community/FoldingAtHome|Documentation Ubuntu]] (en anglais), notamment:
-- l'installateur semi-officiel [[https://help.ubuntu.com/community/FoldingAtHome/finstall|finstall]] qui permet de faire tourner F@H en Daemon (sans fenêtre).
+==== Installation via Origami (paquet inclus dans les dépôts)====
-- l'installateur pour réseaux [[https://help.ubuntu.com/community/FoldingAtHome/folding.sh|folding.sh]]
+(pour pc local et réseaux)
+     * [[:origami|Installation et lancement automatique avec l'installateur Origami]] inclus dans les dépots d'Ubuntu.
-==== Installation ====
+==== Installation via finstall ====
-  * Par exemple dans /home/[utilisateur]/fah
+(pour pc local seulement)
+     * [[:fah_finstall|Installation et lancement automatique avec l'installateur finstall]].
-  mkdir ~/fah
-  * Télécharger le client F@H dans le dossier nouvellement créé
+==== Installation manuelle ====
-  cd ~/fah
+(pour pc local seulement)
-  wget http://www.stanford.edu/group/pandegroup/release/FAH504-Linux.exe
+pour 32bits et 64 bits:
+     * [[:fah_installation_manuelle|Installation manuelle et lancement automatique]]
-  * Changer les droits du fichier
-  chmod +x FAH504-Linux.exe
+===== Suivi du travail en cours =====
+Il existe plusieurs applications graphiques de suivi:
+  * [[http://prothink.sourceforge.net/|Protein Think]]
+  * [[http://fahmon.net/|FahMon]] (pour l'installation voici [[http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=703180|un sujet du forum anglais]] qui s'inspire de [[http://trac.fahmon.net/wiki/CompilingForLinux|cette page officielle]])
-  * Exécuter le programme afin de paramétrer F@H ([[http://folding.extremeoverclocking.com/team_list.php|Liste des équipes]], Ubuntu: 45104, ou Alliance Francophone: 51, ou Linux: 163 ou ...)
+===== Limitation de l'utilisation CPU====
-  ./FAH504-Linux.exe -configonly
+  * [[:cpulimit]] : permet de limiter l'utilisation du ou des processeur(s) par un processus déjà lancé ou qui le sera.
+  * (en) [[https://ubuntuforums.org/showthread.php?t=992706|Discussion à propos de l'utilisation de l'utilitaire cpulimit avec F@H]]
-  * Entrer les infos requises
+===== TeamUbuntu (45104) =====
+Si vous aimez Ubuntu, vous pouvez choisir de rejoindre la [[https://wiki.ubuntu.com/FoldingAtHomeTeamUbuntu|TeamUbuntu]] en choisissant l'équipe n°45104 lors de votre installation.
+===== Liens utiles =====
-==== Création du fichier de demarrage automatique  ====
+  * [[https://help.ubuntu.com/community/FoldingAtHome|F@H sur Documentation Ubuntu (en anglais)]]
+  * [[https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=6803|Topic de discussion F@H sur le forum Ubuntu-fr]]
-  * Créer un fichier nommé fah dans le dossier /etc/init.d
+  * [[http://forum.folding-community.org/viewtopic.php?t=11700|Folding forum (anglais)]]
+  * [[http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&teamnum=45104|Statistiques de la TeamUbuntu]]
-  sudo gedit /etc/init.d/fah
-  * Maintenant, copier les infos suivantes à l'intérieur
-  #!/bin/sh
-  # /etc/init.d/fah for Ubuntu
-  # Start/stop/restart the F@H service.
-  export FAH_HOME=/home/[utilisateur]/fah
-  fah_start() {
-  if [ -x "$FAH_HOME/startfah.sh" ]; then
-  echo "Starting F@H: $FAH_HOME/startfah.sh"
-  "$FAH_HOME/startfah.sh"
-  fi
-  }
-  fah_stop() {
-  sudo killall FAH504-Linux.exe
-  }
-  fah_restart() {
-  fah_stop
-  sleep 2
-  fah_start
-  }
-  case "$1" in
-  'start')
-  fah_start
-  ;;
-  'stop')
-  fah_stop
-  ;;
-  'restart')
-  fah_restart
-  ;;
-  *)
-  fah_start
-  esac
-Sauvegarder et fermer gedit.
-  * Changer les droits du fichier
-  sudo chmod +x /etc/init.d/fah
-==== Démarrage automatique au lancement d'Ubuntu ====
-  * Maintenant, nous allons créer le script startfah.sh
-  gedit ~/fah/startfah.sh
-  * Copier les informations suivantes à l'intérieur
-  #!/bin/sh
-  export FAH_HOME=/home/[utilisateur]/fah
-  cd $FAH_HOME
-  $FAH_HOME/FAH504-Linux.exe >/dev/null 2>&1 &
-  exit 0
-Vous pouvez ajouter les paramètres -forceasm et -advmethods ou d'autres ...
-Plus d'infos sur (en anglais) : [[http://www.liquidninjas.com/bbs/showthread.php?t=3270]]
-  * Changer les droits du fichier
-  chmod +x ~/fah/startfah.sh
-  * Etape finale, créer un lien dans ///etc/rc2.d//
-  sudo ln -s /etc/init.d/fah /etc/rc2.d/S99fah
-Pour tester le script, rebooter ou entrer la commande :
-  sudo /etc/init.d/fah start
-Lancer le moniteur système, l'utilisation CPU doit être a 100% !!!
-==== Remarques ====
-  * 1- Si le programme ne se lance pas à la session suivante, revérifier chacune des étapes. Si tout est correct, essayer la manipulation suivante:
-  sudo apt-get install bum
-Pour Ubuntu « Gutsy Gibbon » 7.10 il suffit de [[apt://bum|cliquer ici]].
-Ensuite, aller dans Système->Administration->BootUp Manager
-Vérifier que le script fah soit bien présent dans la liste et coché. On peut également démarrer/arrêter le service depuis ce programme si besoin.
-Une fois coché, valider les changements et relancer la session. Le programme Folding@Home devrait se lancer.
-Relancer le script
-==== Suivi du travail en cours ====
-  * Différents outils permettant par exemple de suivre l'évolution du travail en cours sont disponible sur [[http://forum.folding-community.org/viewtopic.php?t=11700|cette page]]
-  * Exemple de suivi graphique: [[http://sourceforge.net/project/screenshots.php?group_id=164311|Protein Think]]
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-//Contributeurs : Traduit/Rédigé par [[utilisateurs:dukiclock]] et[[utilisateurs:YannUbuntu]]
+//Contributeurs : Traduit/Rédigé par [[utilisateurs:dukiclock]] et [[utilisateurs:YannUbuntu]]
 Remarques et commentaires  sur le [[http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?pid=44821#p44821|forum Ubuntu-fr]].//