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imagej [Le 30/03/2025, 10:04]
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Peregrinis continuation
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   * [[https://​imagej.net/​software/​imagej2/​|ImageJ2]],​ une version spécialisée dans l'​imagerie scientifique qui comprend des fonctionnalités supplémentaires.   * [[https://​imagej.net/​software/​imagej2/​|ImageJ2]],​ une version spécialisée dans l'​imagerie scientifique qui comprend des fonctionnalités supplémentaires.
   * [[https://​imagej.net/​software/​fiji/​|Fiji]],​ un fork communautaire de ImageJ et ImageJ2 qui regroupe de nombreux plugins, comporte une fonction de mise à jour automatique et offre une documentation complète. Fiji se compare à ImageJ comme Ubuntu se compare à Linux.   * [[https://​imagej.net/​software/​fiji/​|Fiji]],​ un fork communautaire de ImageJ et ImageJ2 qui regroupe de nombreux plugins, comporte une fonction de mise à jour automatique et offre une documentation complète. Fiji se compare à ImageJ comme Ubuntu se compare à Linux.
 +  * [[https://​imagej.net/​software/​bio7|Bio7]],​ un fork dédié aux sciences de la terre et de l’environnement.
  
 ===== Utilisation===== ===== Utilisation=====
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 Lancer l'​application comme indiqué [[tutoriel:​comment_lancer_application|ici]]. Lancer l'​application comme indiqué [[tutoriel:​comment_lancer_application|ici]].
  
-De très nombreux tutoriels sont disponibles [[https://​imagej.net/​tutorials/​|sur le site officiel]] dont [[https://​imagej.net/​ij/​docs/​guide/​user-guide.pdf|le guide utilisateur officiel]] ​(en anglais). De nombreuses universités et scientifiques ont également publié des tutoriels et des cours. Citons comme première approche le [[https://​www.youtube.com/​watch?​v=bBGi12bO_t0|tutoriel vidéo d'​Audrey Dussutour]] où elle explique comment participer à l'​étude du Blob grâce à ImageJ. Pour une approche ​plus complète en français, voir le [[https://​www.infinity.inserm.fr/​wp-content/​uploads/​2021/​06/​Formation-ImageJ.pdf|manuel d'​analyse d'​images publié par l'​Inserm]].+De très nombreux tutoriels sont disponibles ​en anglais ​[[https://​imagej.net/​tutorials/​|sur le site officiel]] dont [[https://​imagej.net/​ij/​docs/​guide/​user-guide.pdf|le guide utilisateur officiel ​complet]]. Pour une première approche, consulter [[https://​imagej.net/​ij/​docs/​pdfs/​ImageJ.pdf|cette description]] et [[https://​imagej.net/​ij/​docs/​pdfs/​examples.pdf|ces exemples]]. 
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 +De nombreuses universités et scientifiques ont également publié des tutoriels et des cours. Citons comme première approche le [[https://​www.youtube.com/​watch?​v=bBGi12bO_t0|tutoriel vidéo d'​Audrey Dussutour]] où elle explique comment participer à l'​étude du Blob grâce à ImageJ. Pour une approche complète en français, voir le [[https://​www.infinity.inserm.fr/​wp-content/​uploads/​2021/​06/​Formation-ImageJ.pdf|manuel d'​analyse d'​images publié par l'​Inserm]].
  
 Une liste de plugins qui permettent d’ajouter de nouvelles fonctions à ImageJ est disponible sur [[https://​imagej.net/​ij/​plugins/​index.html|le site officiel]]. Parmi eux, citons [[https://​bio-formats.readthedocs.io/​en/​stable/​about/​index.html|Bio-formats]] qui permet de lire la plupart des formats d'​image propriétaires obtenus avec les microscopes et [[https://​imagej.net/​ij/​plugins/​3d-viewer/​index.html|Image 3D viewer]] qui permet la visualisation 3D (nécessite Java 3D). Ces deux plugins sont préinstallés dans Fiji. Une liste de plugins qui permettent d’ajouter de nouvelles fonctions à ImageJ est disponible sur [[https://​imagej.net/​ij/​plugins/​index.html|le site officiel]]. Parmi eux, citons [[https://​bio-formats.readthedocs.io/​en/​stable/​about/​index.html|Bio-formats]] qui permet de lire la plupart des formats d'​image propriétaires obtenus avec les microscopes et [[https://​imagej.net/​ij/​plugins/​3d-viewer/​index.html|Image 3D viewer]] qui permet la visualisation 3D (nécessite Java 3D). Ces deux plugins sont préinstallés dans Fiji.
  • imagej.txt
  • Dernière modification: Le 30/03/2025, 10:25
  • par Peregrinis