Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
r [Le 04/10/2018, 10:10] 109.23.254.79 |
r [Le 16/04/2025, 07:08] (Version actuelle) 81.220.55.246 [Via un mirroir du CRAN (version plus récente)] |
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==== Via un mirroir du CRAN (version plus récente) ==== | ==== Via un mirroir du CRAN (version plus récente) ==== | ||
- | Afin de disposer de la version la plus récente de **R**, il faut ajouter un dépôt aux sources de logiciels selon la syntaxe suivante : | + | Source : [[https://mirror.ibcp.fr/pub/CRAN/]] |
<code> | <code> | ||
- | sudo add-apt-repository "https://<miroir.cran>/bin/linux/<version.ubuntu>/" | + | # update indices |
- | </code> | + | apt update -qq |
- | Une liste des miroirs du CRAN est disponible [[https://cran.r-project.org/mirrors.html|ici]]. La commande doit donc ressembler à cela : | + | # install two helper packages we need |
- | <code> | + | apt install --no-install-recommends software-properties-common dirmngr |
- | sudo add-apt-repository "deb https://stat.ethz.ch/CRAN/bin/linux/ubuntu zesty/" | + | # add the signing key (by Michael Rutter) for these repos |
- | </code> | + | # To verify key, run gpg --show-keys /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc |
- | Sous Bionic, utiliser la commande ci-dessous pour accéder au miroir le plus proche : | + | # Fingerprint: E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 |
- | <code> | + | wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc |
- | sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/' | + | # add the R 4.0 repo from CRAN -- adjust 'focal' to 'groovy' or 'bionic' as needed |
- | </code> | + | add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/" |
- | Ensuite, il faut rajouter la clé du serveur : | + | |
- | Sous Xenial : | + | |
- | <code> | + | |
- | sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9 | + | |
- | </code> | + | |
- | Sous Bionic : | + | |
- | <code> | + | |
- | sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9 | + | |
- | </code> | + | |
- | Enfin, on met à jour la liste des paquets et on installe **R** normalement : | + | |
- | <code> | + | |
- | sudo apt-get update | + | |
- | sudo apt-get install r-base r-base-dev | + | |
</code> | </code> | ||
+ | |||
==== Installer une interface graphique ==== | ==== Installer une interface graphique ==== | ||
[[https://www.activestate.com/komodo-ide/downloads/edit|Komodo Edit]] est un éditeur polyvalent et //open-source// qui peut être mis en interface avec R grâce au module complémentaire [[http://www.sciviews.org/SciViews-R/|SciViews-R]]. | [[https://www.activestate.com/komodo-ide/downloads/edit|Komodo Edit]] est un éditeur polyvalent et //open-source// qui peut être mis en interface avec R grâce au module complémentaire [[http://www.sciviews.org/SciViews-R/|SciViews-R]]. | ||
- | [[http://www.rstudio.org/|RStudio]] est un nouvel environnement de développement intégré. RStudio propose de nombreuses fonctionnalités intéressantes, telles la coloration syntaxique, la gestion des fichiers Sweave et LaTeX, un tableur, un gestionnaire de librairies, etc. Pour l'installer, il suffit de télécharger le fichier .deb sur le site de [[http://www.rstudio.org/download/desktop|RStudio]] et de l'ouvrir à l'aide de la logithèque Ubuntu (option par défaut). | + | [[http://www.rstudio.org/|RStudio]] est un nouvel environnement de développement intégré. RStudio propose de nombreuses fonctionnalités intéressantes, telles la coloration syntaxique, la gestion des fichiers Sweave et LaTeX, un tableur, un gestionnaire de librairies, etc. Pour l'installer, il suffit de télécharger le fichier .deb sur le site de [[http://www.rstudio.org/download/desktop|RStudio]] et de l'ouvrir à l'aide de la logithèque Ubuntu (option par défaut). |
[[http://rkward.sourceforge.net/|RKward]] est une interface graphique de R pour KDE. [[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|Installez le paquet]] **[[apt>rkward]]** pour en bénéficier. | [[http://rkward.sourceforge.net/|RKward]] est une interface graphique de R pour KDE. [[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|Installez le paquet]] **[[apt>rkward]]** pour en bénéficier. | ||
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[[http://rgedit.sourceforge.net/|rgedit]] est un plugin pour utiliser R avec [[gedit]]. Pour l'installer, télécharger la dernière version sur le site, extraire les fichiers dans .gnome2/gedit/plugins puis activer le pluging dans gedit, Édition-> Préférences->Greffons | [[http://rgedit.sourceforge.net/|rgedit]] est un plugin pour utiliser R avec [[gedit]]. Pour l'installer, télécharger la dernière version sur le site, extraire les fichiers dans .gnome2/gedit/plugins puis activer le pluging dans gedit, Édition-> Préférences->Greffons | ||
- | [[http://www.walware.de/goto/statet|StatET]] est un plugin pour utiliser R avec Eclipse. Il permet une reconnaissance syntaxique, offre un explorateur d'objet... Pour l'utiliser il faut installer le package rJava au préalable. | + | [[http://www.walware.de/goto/statet|StatET]] est un plugin pour utiliser R avec Eclipse. Il permet une reconnaissance syntaxique, offre un explorateur d'objet... Pour l'utiliser il faut installer le package rJava au préalable. |
On peut aussi utiliser [[:emacs]] avec le mode ESS (emacs speaks statistics). | On peut aussi utiliser [[:emacs]] avec le mode ESS (emacs speaks statistics). | ||
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==== En anglais ou autre ==== | ==== En anglais ou autre ==== | ||
- | * Vous trouverez la documentation officielle [[http://cran.univ-lyon1.fr/manuals.html|ici]]. | + | * Vous trouverez la documentation officielle [[http://cran.univ-lyon1.fr/manuals.html|ici]]. |
- | * On peut aussi consulter le wikibook [[http://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming|R programming]]. | + | * On peut aussi consulter le wikibook [[https://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming|R programming]]. |
===== Aide et support ===== | ===== Aide et support ===== | ||
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* [[https://larmarange.github.io/analyse-R|analyse-R]] une série de tutoriels très complets et accessibles aux débutants sur l'analyse de données avec **R** | * [[https://larmarange.github.io/analyse-R|analyse-R]] une série de tutoriels très complets et accessibles aux débutants sur l'analyse de données avec **R** | ||
* [[http://abcdr.guyader.pro/|L'abcdR]] scripts et astuces **R** | * [[http://abcdr.guyader.pro/|L'abcdR]] scripts et astuces **R** | ||
- | * [[http://forums.cirad.fr/logiciel-R/index.php|Forum Web]] hébergé par le Cirad | + | * [[https://forums.cirad.fr/logiciel-R/index.php|Forum Web]] hébergé par le Cirad |
* [[http://www.developpez.net/forums/f1179/autres-langages/autres-langages/r/|Forum Web]] du site developpez.net | * [[http://www.developpez.net/forums/f1179/autres-langages/autres-langages/r/|Forum Web]] du site developpez.net | ||
* Canal IRC francophone sur R : #Rfr sur irc.freenode.net, ou via une [[http://java.freenode.net/index.php?channel=Rfr|interface Web]] (en Java) | * Canal IRC francophone sur R : #Rfr sur irc.freenode.net, ou via une [[http://java.freenode.net/index.php?channel=Rfr|interface Web]] (en Java) | ||
+ | * [[https://www.youtube.com/watch?v=sav3Mbe0_DM|Le Chat septique explique les bases de R et RStudio]] | ||
===== Sources ===== | ===== Sources ===== |