Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- sim4 [Le 15/01/2010, 15:15]
frombenny TAG
+++ sim4 [Le 27/06/2017, 19:58] (Version actuelle)
gotgot [Sim4]
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 ====== Sim4 ======
+Sim4 est un outil en invite de commande se basant sur les similitudes pour aligner une séquence d'ADN exprimée (EST, ADNc, ARNm) avec une séquence génomique pour un gène. Il détecte également les correspondances de terminaisons lorsque deux séquences entrées se recouvrent sur une terminaison. il utilise la technique du[[ http://dna.cs.byu.edu/bio365/assignments/text6.shtml|BLAST]]
-Logiciel de S.V.T sur l'alignement du code génétique et mutation
+===== Installation =====
+Pour installer ce logiciel, il suffit d'[[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|installer le paquet]] **[[apt>sim4|sim4]]**.
-  * Se trouve dans le dépôt Universe : [[apt://sim4]]
+===== Désinstallation =====
+Pour supprimer cette application, il suffit de [[:tutoriel:comment_supprimer_un_paquet|supprimer son paquet]]. Selon la méthode choisie, la configuration globale de l'application est conservée ou supprimée. Les journaux du système, et les fichiers de préférence des utilisateurs dans leurs dossiers personnels sont toujours conservés.
-  * Online: [[http://gamay.univ-perp.fr/analyse_seq/sim4]]
+===== Voir aussi =====
-  * Site web: [[http://globin.cse.psu.edu/html/docs/sim4.html]]
+     * [[http://globin.cse.psu.edu/html/docs/sim4.html|Information sur sim4]]
+     * [[http://gamay.univ-perp.fr/analyse_seq/sim4|Online]]
+     * [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4101998/|(en) Utilisation]]
+     * [[http://sibsim4.sourceforge.net/|SIBsim4 (basé sur sim4)]] (([[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|Installez le paquet]] **[[apt>sibsim4|sibsim4]]**.))
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+//Contributeurs principaux :
-Voir aussi : [[apt://sibsim4]] , qui est une basé sur sim4.